Первое, что следует отметить, это то, что вопрос звучит недостаточно ясно и содержит два независимых утверждения: "Проходит час" и "другой". Это могут быть два отдельных события, которые не связаны между собой.
Если мы предположим, что вопрос корректно звучит как "Проходит час, другой час. Почему запятая?", ответ будет следующим:
Запятая в данном случае не является обязательным элементом пунктуации и может использоваться или не использоваться в зависимости от того, какой смысл мы хотим выразить.
Если мы поставим запятую между словами "час" и "другой", то мы подчеркнем их разделение во времени. То есть мы говорим о том, что прошел один час, а затем начался другой, отдельный по времени.
Если же мы не ставим запятую между словами "час" и "другой", то мы создаем единообразную картину времени, где непрерывность и смысловая связь между часами сохраняется. Это может означать, что первый час прошел, и сразу после него начался следующий час.
В обоих случаях смысловая нагрузка зависит от контекста, в котором используется фраза "Проходит час, другой час". Если это фраза из повествования, то применение или не применение запятой может изменить характер повествования и уточнить, насколько новый час связан со старым по времени. Если же это описание последовательности событий, то применение или не применение запятой может как уточнить, так и смягчить смысл, который мы хотим передать.
Кроме того, следует отметить, что правила использования запятой в русском языке не являются жесткими и могут меняться от ситуации к ситуации. Использование запятой в определенных случаях может быть вопросом стиля и предпочтений автора или редактора. Поэтому правильнее говорить не о том, почему запятая, а почему автор или редактор выбрали использовать или не использовать запятую в данном контексте.